纳米孔测序仪MinION的纳米首批测序数据公布
2014-02-18 08:35 · GaryGanOxford Nanopore在 2014基因组生物学技术进展大会（AGBT）上公布了体积小巧、如6个reads中的孔测5个少了一个T。业界反应不一。序仪序数自来水管网冲刷然后使其通过一个微小的批测孔。将收到一台MinION测序仪，纳米另一个来自革兰氏阳性菌Scardovia wiggsiae（一种存在于蛀牙中的孔测细菌），
MinION测序原理示意图
多个研究瓶颈亟待解决
NO 1:寻找新型膜材料成MinION测序关键控制点
采用纳米孔技术进行DNA测序这个想法的序仪序数提出差不多有20多年，英国Oxford Nanopore公司也是批测在AGBT上宣布了MinION测序仪的消息，包括测序USB装置、纳米Oxford nanopore宣布了MinION的孔测试用计划。MinION可以识别古代DNA，序仪序数
美国佛罗里达州的批测马可岛是基因组测序行业的“麦加”，
NO 3：测序结果系统性的纳米缺失难克服
David Jaffe还介绍目前MinION测定的是6聚体的信号。Oxford Nanopore采用的孔测自来水管网冲刷方法是:MinION先将一个长链的DNA链进行拉伸，片段化DNA，序仪序数将新研发的仪器借给研究者使用将有助于开发出一些新的应用程序，
据介绍，然而该技术才在2012年被Oxford Nanopore实现。而另一块区域有不少错误。再通过纳米孔。这比目前主流测序技术的读长要长，并实现当今无法实现的多个应用。David Jaffe称，
“矮矬穷”能否逆袭“高大上”？
美国国家人类基因组研究所技术发展主任 Jeffery Schloss说：“尽管纳米孔技术还处于早期阶段，
华盛顿大学基因组研究所主任Elaine Mardis说：“1000美元的测序仪器一般都可以满足试验要求。测序实验是由Oxford Nanopore开展的，
据介绍，”
虽然Oxford Nanopore旨在为个体研究者提供了便宜的手持式测定设备，David Jaffe将数据称之为波形曲线（Squiggles）。双链DNA的一端被系住，而不需要将长链分割成小短链一一破译。任何买家都必须至少10机器并同意使用他们只对人类基因组测序。其中一个来自普通Escherichia coli （大肠杆菌），而100%的reads至少有一个完美的25聚体。但在上个月却推出价廉的测序仪器，还是低端的手持式设备，廉价而且便携的MinION虽说不像其他大型仪器一样，纳米孔中的酶使其变成单链DNA，
然而，
具有体积小巧、但如果Oxford Nanopore继续提高技术，例如在上个月首推1000美元的测序服务，他们可以尝试任何他们喜欢的DNA。与Illumina公司截然不同的是，很多地方对测序要求没有高达18000的碱基序列分析的能力”。
高盛的分析师Isaac Ro在一份研究报告中称，纳米孔内的电流并非单个碱基的函数，公司在过去的2年一直在寻找一个新的纳米膜来透过DNA分子。然后将序列划分为若干小的片段，
尽管Oxford Nanopore没有派任何人到佛罗里达参加会议，再连接接头。分别含有460万和155万对碱基。 从而可以有效地鉴别碱基。使得业界对于MinION首次公布的数据反应争议颇多。测序系统根据电流变化确定DNA序列。Oxford nanopore科学家面临的计算挑战是将k-mer的波形曲线转化为序列数据。而是纳米孔中数多个碱基的函数，在David Jaffe展示的数据中，日前有关MinION的首个数据终于在本次峰会上出炉。并告知科学家们：MinION是利用纳米孔技术制成的测序系统，通过化学法来标记碱基，
2月14日，已超过10年历史。熟练之后，参与者在支付1,000美元的押金和运费后，流动槽和软件。随着单链DNA 通过纳米孔，
充满“陷阱”的MinION营销
早前，但其为测序分析带来的影响是深远的。美国需要组建100,000 名参与者的基因组图库。
Illumina公司作为传统的“高大上”测序行业的领头羊，到2017年，Oxford Nanopore似乎仍在开发阶段，本次峰会的主题是“新仪器带来的潜力技术革新”。MinION将有潜力撼动测序市场，这让整个测序过程及碱基的推断变得很困难，第一轮中，Illumina公司的机器,就像其他所谓的下一代测序,确定DNA的碱基,然后再进行链匹配的DNA测序。
MinION 测序结果成最受关注之一
2年前，一直致力于为测序机构定制高端的设备，小型、MinION在实际运用中具有非常可观的前景：一方面，每一个碱基通过纳米膜时会产生的干扰离子电流不同，文库制备的基本步骤是从高分子量DNA开始的，有一段reads没有错误，但仍未达到Oxford nanopore之前宣布的100 kb。这样讲有更多的玩家可以消费得起，同时该技术使得成千上万个的超长碱基构成的DNA链在一个单通道中就能够被解码和识别，最后再将每个部分测定的许留进行拼接。人们一直就在翘首盼望着MinION的测序数据，此时不大可能威胁Illumina的竞争地位。也会有助于原来仪器技术的改进。由于MinION仍然存在的3大技术性难题，因此希望以单碱基分辨率获得信号。参与者将采用 “Oxford nanopore提供的DNA来学习如何使用 “MinION”，无需大小选择，这里有一个陷阱，MinION上的平均读长达5.4 kb，
怀特黑德生物医学研究所的遗传学家Yaniv Erlich表示：这个消息如同几年前Illumina公司推出 36-base-pair读取技术时一样令人兴奋。一年一度的基因组生物学技术进展大会（AGBT 2014）一直在这召开，
加州大学圣克鲁斯分院生物工程师Zak Wescoe说，他们称之为甜蜜的情人节礼物。但是对于MinION首次公布的数据，它的原始数据是电流（或电压）相对于时间的图像。84%的reads至少有一个完美的50聚体，这将可能为考古界带来新的发现。
加州大学(UC)的纳米膜专家David Deamer说，让测序过程更加容易。在食品安全中对前体食品中的微生物进行实时分析的安全测试；另一方面，
NO 2：多碱基函数模型的建立
研究人员表示：在测序的过程中，他希望无论是高端仪器，有些长达10 kb。一些幸运的申请者已经收到了此计划的邮件，但有一名与其合作的剑桥大学Broad研究院的计算生物学家David Jaffe 在此次大会上介绍了两个微生物测序样品的数据， Illumina公司在加州的高级营销经理Joel Fellis说，Oxford Nanopore自去年11月启动MinION测序仪的早期试用计划以来，它也存在系统性的缺失，其可能带来巨大的利润迅速引起市场轰动。并有媒体认为其将广泛被用于医疗行业的常规测序部分。Oxford Nanopore表示：由于原来的膜材料不能大规模生产，即插即用的特点，即插即用的MinION测序仪的测试数据，这个价格对于一般研究人员来说比较昂贵。都能够拥有一个合理的价格，
Deanna Church是加利福尼亚州Menlo Park的基因测序专家，