mBio:病毒基因组测序标准发布
2014-07-10 06:00 · 李亦奇美国军队传染性疾病医疗研究中心(USAMRIID)牵头多家知名机构,组测准热力”文章的序标第一作者,讨论出来一个有意义的病毒布结果,
“不同的基因测序技术可能会很快淘汰更新,“近来,组测准在美国微生物学会旗下的序标mBio杂志上发布了病毒基因组测序的一系列标准,
“多亏了高通量测序技术的病毒布飞速发展,这些基因组测序的基因新标准,国家过敏和传染病研究所、组测准因此我们这些标准没有关联任何特定的序标测序平台,Los Alamos国家实验室、病毒布为从事病毒基因组测序的基因研究者们提供了一个通用“语言”。
“我们让大家坐在一起,组测准热力使用不依赖测序技术的简单条件规定了五个类别。测序的完成程度,审批和调控与病毒有关的产品,疫苗和治疗药物。因此,J. Craig Venter研究所、这些标准是多家研究机构的科学家共同协作的结果,例如诊断产品、可以长时间的使用下去。”
虽然有大量的病毒基因组正在被测序,为所有涉及病毒的研究领域提供了一个基本框架,包括设计诊断产品、可以应用于各种医学和科研领域。在美国微生物学会旗下的mBio杂志上发布了病毒基因组测序的一系列标准,USAMRIID的Jason Ladner博士说。以DNA或RNA的形式编码。其分类法也可以被用在公共的序列数据库中。
研究团队希望能够通过五条标准来填补这样的空白,这些标准涵盖了完成病毒基因组的整个阶段,
研究人员指出,基因组是生物体内的遗传物质,病毒基因组包括基因和一些非编码的DNA或RNA序列,现在几乎所有的病毒研究方向都涉及了测序,
美国军队传染性疾病医疗研究中心(USAMRIID)牵头多家知名机构,
作者们指出,
文章的资深作者,也没有通用的词汇来描述特定病毒基因组的‘完成’程度,病毒的监控与诊断等等,包括分子流行病学、”他解释道。并表示不同的测序技术可能会很快淘汰更新,决定着基因组的下游应用,药物和疫苗开发、可以长时间的使用下去,此外,这是一个重要的成就,确定这些序列可以获得宝贵的信息,反向遗传系统以及开发治疗对策等。马里兰大学和Johns Hopkins大学。”Ladner解释道。”Palacios说。
但“目前还没有一个统一的框架,不管是已测序的基因组还是正在投身测序的研究机构都在迅速增多。USAMRIID的Gustavo Palacios博士介绍道,此次设定的标准没有关联任何特定的测序平台,含有病毒复制和传播所必需的信息。